（按时间顺序排列）

    1月6日，中央国家机关工委决定（国机精〔2009〕2号文件），授予国家中医药管理局医政司为中央国家机关“创建文明机关 争做人民满意公务员”活动先进单位；授予国家中医药管理局国际合作司亚美多边处处长朱海东同志、科技司中医科技处副主任科员陈丽娜同志为中央国家机关“创建文明机关 争做人民满意公务员”活动先进个人，并予以通报表彰。
    1月23日，中央精神文明建设指导委员会决定，授予中国中医科学院广安门医院“全国文明单位”称号。
    3月25日，中央国家机关7部门（精神文明、综合治理、绿化、计划生育、爱国卫生、交通安全、环境整治）决定（国机精〔2009〕2号文件），授予中国中医科学院广安门医院“中央国家机关文明单位标兵”称号；授予国家中医药管理局机关服务中心、中国中医科学院西苑医院、望京医院、眼科医院“中央国家机关文明单位”称号；授予中国中医科学院广安门医院闫桐同志“中央国家机关‘平安奥运行动’先进工作者”称号。
    4月20日，中央国家机关工会联合会决定，表彰国家中医药管理局中国中医科学院广安门医院先进集体，颁发中央国家机关五一劳动奖状；表彰国家中医药管理局党组成员、办公室主任王志勇同志、国家中医药管理局中国中医科学院眼科医院名誉院长唐由之同志先进个人，颁发中央国家机关五一劳动奖章。
    6月18日，首都精神文明建设委员会决定（精建〔2009〕9号文件），授予中国中医科学院广安门医院“2008年度首都文明单位标兵”称号；授予中国中医科学院西苑医院、望京医院、眼科医院“2008年度首都文明单位”称号。
    7月2日，中央国家机关工会联合会决定（国机工办〔2009〕151号文件），授予国家中医药管理局直属机关工会2008年财务工作优秀奖。
    11月3日，首都精神文明建设委员会决定，国家中医药管理局直属机关党委获“首都‘迎国庆讲文明树新风’活动先进单位”称号；国家中医药管理局直属机关团委副书记刘灿、机关工会工作人员孟繁琪同志获“首都‘迎国庆讲文明树新风’活动先进个人”称号。
    11月6日，中央国家机关党工委组织部、中央国家机关团工委决定，授予国家中医药管理局直属机关党委国庆60周年群众游行活动“突出贡献单位”称号；授予国家中医药管理局直属机关团委国庆60周年群众游行活动“优秀组织单位”称号；授予国家中医药管理局（中国中医科学院西苑医院）李丁同志国庆60周年群众游行“优秀队员”称号。
    11月12日，中央国家机关党工委组织部通报，国家中医药管理局2008年度党内统计报表被评为中央国家机关2008年度全优报表。
    12月4日，中央国家机关团工委决定（国团工组〔2009〕72号文件），授予国家中医药管理局直属机关团委“根在基层”调研实践活动优秀组织奖。
    12月18日，国家中医药管理局乒乓球代表队获“中国移动激情100”乒乓球赛北京赛区团体冠军。
    12月20日，北京市公安局授予中国中医科学院“集体三等功”，授予国家中医药管理局办公室副主任蒋健、国家中医药管理局办公室综合处处长陈伟、国家中医药管理局社会治安综合治理办公室主任杨锐等3名同志“个人三等功”，授予国家中医药管理局机关服务中心赵丽蓉、周建民、中国中医科学院眼科医院张进洲、中国中医科学院信息研究所侯阳等4名同志“个人嘉奖”。